In principe wordt alles wat er binnen de bond gebeurt georganiseerd door leden, dus jongeren tussen de 12 en 25 jaar. Wel is er enige verdeling van wie wat doet in welk bestuur: lokaal zijn meestal de jongste mensen bestuurlijk actief, regionaal iets ouder, en in het landelijk bestuur zitten meestal de NJN-leden met veel (bestuurlijke) ervaring binnen de NJN.

Uitzonderingen zijn de kascommissie, dit zijn oud-leden die de administratie controleren, en excursieleiders die van buiten de bond worden uitgenodigd.

Organisatiestructuur

De hele organisatie wordt door de leden zelf gedaan. De NJN bestaat uit meerdere bestuurslagen die voor een deel ook parallel lopen. Er is een hoofdbestuur (HB) bestaande uit zes mensen, die de landelijke organisatie coordineren. Dat wil zeggen er is een voorzitter, een penningmeester en een secretaris, en voor de verschillende commissies zijn er de coordinatoren. Er is een commissie externe zaken, voor dingen als publiciteit en naamsbekendheid, er is een commissie bondszaken die de communicatie binnen de bond, het materiaal van de bond en de zomerkampen coordineert, en er is een commissie natuurzaken die voor de natuurstudie binnen de bond zorgt.

Ook zijn er regionale besturen (districten en afdelingen). Een afdeling is de kleinste eenheid binnen de NJN, die zorgt voor dingen als plaatselijke publiciteit en excursies in de buurt. Er zijn ongeveer 35 afdelingen. Districten bestaan uit een aantal afdelingen, de meeste districten komen ongeveer overeen met de provincie waar ze zich bevinden. De belangrijkste activiteit van de districten is het organiseren van de kampen. De indeling van afdelingen en districten kun je zien op dit kaartje.

Naast besturen per plaats, zijn er ook werkgroepen die zich bezig houden met een bepaald thema. Zo hebben we bijvoorbeeld de Vogelwerkgroep en de Zoogdierenwerkgroep. De werkgroepen zorgen ervoor dat van hun onderwerp veel kennis binnen de bond blijft, dat er excursieleiders 'opgeleid' worden, en dat er veel kampen komen waar je ook echt wat kunt leren.